二零零三年，黑龙江省密山市的杨晓光被劫持到牡丹江监狱一监区。二零零四年十月左右，杨晓光提出要公开学法炼功，被关入小号。在小号里，杨晓光遭到了狱警宋军林的残酷迫害。宋军林每次值班喝完酒，就将杨晓光毒打一次，有一天晚上连续毒打了三遍。杨晓光的脸被打的变了形，眼睛看不见东西，在小号里关了二十几天后才被放出来。

二零零四年十二月上旬，一监区教导员李杰志、干事李玉宏对狱警威逼利诱，不管采用什么办法都要让法轮功学员转化。在狱警的指使、怂恿下，抢劫杀人犯刘立军，几近疯狂的对杨晓光、孙荣孝、刘国来进行殴打。杨晓光被刘立军打的口鼻流血、面目青肿，口腔多处破裂，无法进食。刘国来被打的眼眶青紫，肋骨折断三根，躺在地上起不来；五十多岁的孙荣孝在短短四天时间里两次惨遭毒打：第一次被打的面目全非；时隔两日又被打的满地直滚，遍体鳞伤。

监狱集训队的迫害更加残酷，为了达到对学员强行转化，调动了小号和各监区的干警用电棍电、扣地环、灌浓盐水等酷刑折磨法轮功学员。

姚国才在关小号期间绝食十五天抗议，狱警便指使犯人对姚国才强制灌食，这种残忍的灌食方法就是将管子从口中一直插入胃部，灌入食物时，再人为的进行上下拉动，以达到折磨的目的，姚国才因被灌食导致食道发炎直至发高烧。

浙江的于军修，原是新肇监狱一名被判了无期徒刑的犯人，一九九七年通过狱中干警洪法开始修炼法轮功。二零零零年监狱合并，于军修被转到牡丹江监狱服刑。一天，他将写有“法轮大法好”的字条粘在楼道的墙上。被押小号关禁闭，受到惨无人道的迫害。小号的干警林黎明和刘平把于军修戴上手铐脚镣，再用一根铁链从其背后把手铐和脚镣锁在地环上，而且经常用白塑料管打他。警察许树军用电棍电他，经常一电就是一个小时。于军修被关小号半年，出来没几天就去世了。

除此之外，杜世良，潘兴福、魏晓东、李儒清、宁军、汪继国等人，在牡丹江监狱被迫害致死。